ガンダムファイト決勝大会まで、残すところあと３日に迫っていた。そして、各国のガンダムがぞくぞくとネオホンコンに集結してきている。そのころ、おのおの修行を成し遂げたシャッフル同盟は、まだ修行が終わっていないドモンとともにギアナ高地に残っていた。残り少ない１日が過ぎようとしていたとき、シュバルツは修行に行き詰まったドモンを指導、ドモンは錆びた刀を光らせ"明鏡止水"の境地を成し遂げつつあった。しかし、それもつかの間、マスター・アジアがデスアーミー部隊を引き連れ、ギアナ高地を包囲し攻撃を開始する。
デスアーミー部隊の攻撃とマスターガンダムの必殺技"ダークネスフィンガー"を受け、深手を負ったシャイニングガンダム。チボデーたちシャッフル同盟とそのクルーたちは、一時ネオロシアの陣営に避難していた。シュバルツは、シャイニングガンダムの修理と脱出のため、共同作戦を行うことを提案する。その考えに賛同し、さっそく作戦を開始するシャッフル同盟だったが、デスアーミーは圧倒的な数で包囲網を狭めるのだった。
再び現れたデビルガンダムとマスターガンダム。目の前のデビルガンダムの圧倒的なパワーにダメージを受けたドモンは、シュバルツとともに洞窟へ一時避難する。シュバルツは、ドモンに「明鏡止水」の心で発動させる真のスーパーモードでなければデビルガンダムとマスターガンダムには勝てないと忠告する。しかし忠告を無視し、マスター・アジアに闘いを挑むドモンは弱点をつかれてピンチに追いこまれてしまう・・・。
各国のガンダムより少し遅れて、シャッフル同盟はネオホンコンにたどり着いた。そのころ、ドモンは新型モビルファイター、ゴッドガンダムに乗り込むが動かすことができずにいた。止めを刺すため襲いかかろうとするマスターガンダム。ドモンはゴッドガンダムを起動させマスターガンダムに立ち向かう。
決勝の地、ネオホンコンの開会式会場には、各国からガンダムファイトに勝ち残ってきたモビルファイターが集結。ドモンのゴッドガンダム、チボデーたちシャッフル同盟、シュバルツのモビルファイターもあった。しかし、そこにはガンダムファイトで敗北したモビルファイター達の姿が。さらにギアナ高地でドモンに倒されたはずのマスター・アジアのマスターガンダムまでもが姿を現わし、シャッフル同盟は動揺していた。
